V roku 2021 podstúpil operáciu hrubého čreva, pri ktorej mu odstránili 33 cm črevného traktu. Špekulovalo sa, že má rakovinu, čo však sám poprel.
Dlhé roky trpí ischiasom, čo mu spôsobuje bolesti chrbta a nôh. Tento zdravotný problém ho v roku 2020 donútil vynechať silvestrovskú a novoročnú omšu vo Vatikáne. Kvôli problémom s kolenom odmietol ďalšiu operáciu a rozhodol sa pre alternatívne metódy liečby.
Jeho zhoršujúci sa zdravotný stav ovplyvnil aj jeho cestovný program – v roku 2022 zrušil plánované návštevy Libanonu, Konga a Južného Sudánu.
Prvá láska pápeža Františka
Keď sa v marci 2013 konkláve rozhodlo pre Bergoglia, Amalia Demonteová, jeho prvá láska, ostala v šoku. Ako 12-ročný sa do nej zamiloval a dokonca jej daroval kresbu domu s odkazom, že si ho raz spolu postavia. Amaliin prísny otec však akýkoľvek kontakt zakázal.
Jorge jej vtedy povedal: „Ak si ma nevezmeš, stanem sa kňazom.“ Amalia mu na to neodpovedala, roztrhala jeho kresbu a nikdy viac sa s ním nestretla.

František sa v mladosti rád venoval tancu a medzi jeho záľuby patrilo aj tango. V jednom z rozhovorov priznal, že pred vstupom do seminára mal priateľku, s ktorou chodil tancovať.
Minulosť, na ktorú sa nezabúda
Amalia na svojho detského priateľa nikdy nezabudla. „Nemám čo skrývať. Bol to krásny, čistý vzťah dvoch detí,“ povedala po jeho zvolení za pápeža.

Hoci sa ich cesty rozdelili, stále si ho váži: „Stojí nohami pevne na zemi a zostal skromný. Želám mu, aby dokázal urobiť všetko dobré, čo nosí v srdci.“
Pápež František zomrel 21. apríla ráno, uvádzajú svetové agentúry s odvolaním sa na Vatikán. V poslednom čase trpel vážnymi chorobami. V nedeľu, 20. apríla 2025 krátko pozdravil veriacich pri kázni Urbi et orbi (Mestu a svetu). Na čele katolíckej cirkvi bol osemdesiatosemročný pápež, ktorý pochádzal z Argentíny, 12 rokov.
„Pápež František zomrel na Veľkonočný pondelok, 21. apríla 2025, vo veku 88 rokov vo svojej rezidencii Dom svätej Marty,“ uviedol vo vyhlásení Vatikán. „O 7:35 sa rímsky biskup František vrátil k Pánovi,“ uviedol podľa agentúry AP kardinálov komorník Kevin Farrell, ktorý povedie Vatikán do zvolenia nového pápeža.